كنيسة القلب المقدس خاصة بطائفة اللاتين الكاثوليك والكاثوليك السكندريين بشكل عام وهى على اسم القديس فرنسيس الايسيزى. وهو راهب ايطالى مؤسس الفرنسيسكان. وهى مدرسة رهبانية انتشرت على مستوى العالم. ( ولد سنة 1181م وتوفى سنة 1226 م )
بنيت الكنيسة سنة 1924م وتتميز بروعة رسومات الزجاج بها.

- بعد الدخول من باب الكنيسة نجد فى السقف أيقونة للمسيح فى منتصف السقف وهو مقسم لمربعات ومستطيلات مفرغة 
- على الجوانب أسفل السقف نرى قصة حياة السيد المسيح مرسومة على الزجاج موزعة على عدة أجزاء، كل شباك مرسوم عليه جزء من حياة المسيح. 
- على الجوانب أسفل السقف نرى قصة حياة القديس فرنسيس مرسومة على الزجاج منذ لحظة ميلاده الى لحظة وفاته. ومن الجدير بالذكر ان القديس فرنسيس زار مصر سنة 1219 وتقابل مع السلطان الملك الصالح الذى أعجب به وبتقاوته وأذن له بزيارة الأراضى المقدسة دون أن يعترضه أحد وأعطاه فرمان بذلك. 
- على جوانب الكنيسة يوجد عدة مذابح من اليمين واليسار.
- فى الجهة اليسرى يوجد انبل عليه بعض مواقف من حياة القديس فرنسيس محفورة على الخشب .
-  نصل لأول الكنيسة لنجد المذبح الرئيسى وخلفه تمثال للمسيح على الصليب مع المريمات.
يعلوه تمثال للمسيح. على يمينه أيقونة مرسومة على الزجاج للقديسة كلارا مؤسسة رهبنة الفرنسيكانيات للبنات وعلى يساره أيقونة مرسومة على الزجاج للقديس فرنسيس.
- يعلو كل ذلك أيقونات أخرى زجاجية للسيد المسيح والقديس فرنسيس والقديسة كلارا. ثم لأعلى ملائكة تسبح فى السماء يعلوها صورة للمسيح. 

.